زراعة الخلايا الجذعية الذاتية هي إجراء طبي يتم فيه جمع الخلايا الجذعية من جسم المريض نفسه، وتخزينها، ثم إعادة حقنها بعد علاج مكثف، مثل العلاج الكيميائي أو الإشعاعي. يُعد هذا النوع من الزراعة مفيدًا بشكل خاص لأنه يُزيل خطر الإصابة بداء الطعم حيال المضيف (GVHD)، وهو أحد المضاعفات الشائعة في عمليات الزرع التي يكون فيها المتبرع والمتلقي شخصين مختلفين.